Cara, comigo aconteceu algo parecido com o meu MacMini, tinha Seagate Raptor 500g USB, e depois de parear o Magic Mouse pela primeira vez, meu hd começou a aparecer como 0% de uso, e não me deixava criar nenhuma pasta nem nada, eu tinha 250gb de arquivos, tentei fazer de tudo, liguei no Suporte da Seagate nos EUA, fiz todos os procedimentos que me falaram, liguei no suporte da Apple e ninguém sabia o que tinha ocorrido..
Então peguei esse hd e liguei em outro Note que tenho com Linux(Ubuntu 10.04) e ele reconhece e abriu o HD como somente leitura, mas meus arquivos estavam lá! ai peguei e copiei tudo para outro HD, mas mesmo assim alguns arquivos estavam corrompidos. No final a Seagate mandou eu enviar a HD para eles e me mandaram uma nova e uma semana.. Mas aparentemente era problema na HD pq com uns testes feitos antes de eu enviar, estava cheio de badblocks.