Imcompatibilidade, como? Se fôr uma pergunta como, "o iDisk pode ser usado como disco de backup no Time machine?". A resposta é não.
Logo, não pode ter sido esse disco que "sumiu". Você só pode estar como o disco escolhido ejetado, ou desmontado... Ligue o drive, ligue depois o computador e veja se o disco monta no desktop. Se montou, tá resolvido. O Time Machine vai achar.