Um disclaimer, é que todo e quaisquer aparelhos com bateria recarregável vão desgastar com o tempo. A questão da apple (por mim desativaria isso) é que ela mostra esse desgaste. Isso tem muito a ver com a quantidade de carga que ela veio de fabrica, a contagem de ciclos e até o uso. É normal desgastar com o tempo. Não vai ficar 6 meses em 100%. Além do que, é só uma estimativa. Algo aproximado do real.
Uma das causas pode ser algum app demandando um pouco mais do seu hardware, consumindo mais energia, o que o amigo em cima falou sobre a quantidade da capacidade defabrica, ou nos piores casos o ios puxando mais energia ou até mesmo uma questão de hardware (muito improvável esses últimos 2)