Pessoal, vi que muita gente estava com esse problema e ninguém estava conseguindo resolver.
Bem, no meu caso consegui agora voltar ao normal.
O que pude identificar é que realmente é como se fosse um bug, deletamos os arquivos que eles vão para a lixeira, porém não conseguimos ver.
O que fiz foi deletar a lixeira pelo terminal.
é só digitar no terminar: sudo rm -rf ~/.trash
colocar sua senha: ******* e apertar enter.
Pronto, ele vai "destravar" esse bug.
Abraços.