As dicas que eu sigo são:
1°) fazer backup antes de instalar atualização, principalmente de sistema operacional;
2°) não queira ser o primeiro a instalar as novas versões, pois geralmente tem bugs que os mais experientes resolvem ou a própria Apple tenta consertar e liberar uma versão sem ou com menos problemas (aguarde algumas semanas, apesar de dizerem que a nova versão é maravilhosa...);
3°) e, enfim, se a coisa ficar feia e tendo feito o backup antes, tem com voltar à situação anterior ao estrago (nesse ponto, o Time Capsule é extremamente útil).