O ideal é microfonar o amplificador e não conectar a guitarra direto na porta da interface de áudio.
Mas é aquela conversa: pra quem não vai fazer a parada profissionalmente, não tem problema simplesmente ligar a guitarra numa placa de áudio.
Interface de áudio tem varias boas. Eu recomendo as da Apogee, tipo a duet ou a one, que não é tão cara e é muito boa. Uso uma duet e não existe interface melhor que ela na classe dela.