Boot camp não precisa refazer, favoritos o iCloud puxa...
E quanto ao iTunes eu sei:
Copia toda a pasta de música e do itunes, copia todas as músicas e td mais (se vc deixa o itunes copiar pra biblioteca dele, estarão dentro da pasta do iTunes, melhor ainda, tudo do iTunes fica ali, música, apps, ebooks, etc)
dentro da pasta itunes vc tem o itunes library.itl, é ele q é responsavel pela biblioteca... só abrir ele e vai funcionar como mágica (não esquece que todos os .xml e etc tem que ser copiados tbm)!
(não esquece que tem que ser copiado no mesmo diretório)
Pra quem não sabe, no iPhoto é a mesma coisa: o arquivo iPhoto Library na pasta de imagens tem toda a biblioteca do iPhoto, só copiar e abrir depois de formatar (vi alguem com essa duvida faz pouco tempo aqui)