Cara, isso aconteceu comigo tb qdo eu fui fazer a atualização aqui tb.
Oq eu fiz foi o seguinte, tive que formatar o HD, eu tb achei que tinha zuado, mas foi só formatar e aí a instalação deu td certinho.
A minha sorte é que eu tinha uma particão com bootcamp, e por lá eu conseguia vizualizar meus arquivos do macintosh hd, entao fiz o backup e formatei
Boa sorte!!