Lutei muito para encontrar como resolver isso e vim compartilhar.
Tenho um imac com o keyboard pro (alphanumérico) e sempre sofri com isso.
Baixei o Karabiner Elements
https://pqrs.org/osx/karabiner/
Ao abrir o aplicativo, na primeira aba (Simple Modifications)
From key: Keypad_period
to key: Comma(,)
Reinicia o computador e pronto.